Almanya'da başlayan ve Türkiye'de artçı şokları hissedilen şike skandalında şike yapıldığı iddia edilen karşılaşmalarda Gebzespor'un da adı geçiyor.

Bahis şikesi operasyonu çerçevesinde gözaltına alınan ve bir dönem Gebzespor'a transferi düşünülen milli Futbolcu Fatih Akyel'e cezaevi yolunu açan şike skandalında şike yapıldığı iddia edilen maçlarda Gebzespor'un adı da var.

27.07.2009 tarihinde oynanan Turgutluspor - Gebzespor, 10.08.2009 tarihinde oynanan Gebzespor- K.Şeker, 21.08.2009 tarihinde oynanan Gebzespor - Turgutluspor, 02.09.2009 tarihinde oynanan Eyüpspor - Gebzespor maçlarında karşılaşmaların manifule edildiği iddiası Gebzespor camiasında ve Gebze'de şok etkisi yarattı.